Marchés publics – Dysfonctionnement de l’application Hélios

Risques de retards de paiement des collectivités territoriales et établissements publics

Depuis le 5 février 2026, un incident technique d’ampleur nationale affecte l’application informatique Hélios, pivot de la gestion financière des collectivités territoriales et des établissements publics (santé, EHPAD, etc.). Bien que les services de l’État annoncent un rétablissement, cet événement est de nature à perturber significativement les flux de paiement. Par conséquent, les entreprises sont invitées à suivre rigoureusement l’évolution de leur facturation à destination de leurs clients publics, et à maintenir un contact régulier avec les maîtres d’ouvrage pour identifier les éventuels blocages qui persisteraient.

L’application Hélios constitue l’outil central de la chaîne comptable publique locale. Elle est utilisée par les comptables publics pour le contrôle, la prise en charge, le mandatement et le paiement effectif des dépenses des collectivités territoriales, de certains établissements publics et établissements publics de santé.

Dans le cadre des marchés publics, les factures déposées par les entreprises sur la plateforme Chorus Pro sont transmises aux acheteurs publics, puis intégrées (pour les acheteurs concernés), dans la chaîne comptable et financière via Hélios afin de permettre leur paiement.

Un dysfonctionnement technique de l’application Hélios peut donc bloquer ou retarder le paiement des factures, y compris lorsque celles-ci ont été régulièrement déposées et validées sur Chorus Pro.

Une panne majeure

Hélios utilise deux centres informatiques : Versailles, qui dessert les trois quarts des postes comptables, et Metz, qui couvre le quart restant. Selon les informations en notre possession, c’est ce dernier qui a été le plus touché, le 5 février dernier, par une panne matérielle majeure qui a entraîné un arrêt total de l’application pour les services de gestion comptable qui en dépendent.

La Direction Générale des Finances Publiques (DGFP) avait annoncé un rétablissement progressif du service à compter du 12 février 2026, celui-ci étant a priori à nouveau opérationnel depuis le 19 février dernier. Toutefois, que le service soit à nouveau opérationnel ne signifie malheureusement pas nécessairement un retour immédiat à la normale.

Points de vigilance

Si tant est que les dysfonctionnements techniques soient effectivement résolus, pour les entreprises, le problème ne réside plus dans la panne elle-même, mais dans la saturation de la file d’attente. Près de deux semaines de mandats ont été stockées en amont, et les comptables publics doivent désormais traiter ce stock. Par ailleurs, outre les fournisseurs, les salaires des agents et les prestations sociales étaient également potentiellement impactés…

Le délai de résorption du stock de mandats reste donc incertain, et nous pouvons nous attendre à une persistance de retards sur les prochaines semaines.

Dans ce contexte, certaines collectivités ont déjà communiqué auprès de leurs fournisseurs, et donc vous entreprises adhérentes.

Nous vous invitons à maintenir le dialogue avec vos maîtres d’ouvrage, afin de comprendre la situation propre à chaque collectivité et dans quelle mesure celles-ci peuvent être impactées. Il est nécessaire d’étudier chaque cas individuellement afin d’en évaluer les causes et les impacts.

Recommandations

Il est recommandé aux entreprises :

• de suivre attentivement l’état de traitement de leurs factures ;

• en cas de retard de paiement, de se rapprocher des services de la collectivité concernée ;

• de conserver l’ensemble des justificatifs relatifs aux demandes de paiement transmises ;

• de demander le paiement des intérêts moratoires.

Nous vous invitons à nous faire remonter toute difficulté persistante. 

La FFB suit attentivement l’évolution de la situation. Nous vous tiendrons informés de tout élément nouveau.

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